Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Phoenix Bios Mod Tool unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Phoenix Bios Mod Tool unterstützten Basisdateien sind .SCAP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Phoenix Bios Mod Tool zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Phoenix Bios Mod Tool verwendet werden.
Mit Phoenix Bios Mod Tool können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Phoenix Bios Mod Tool öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Phoenix Bios Mod Tool unterstützten Dateiformat zu speichern.