Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PersonalBrain unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von PersonalBrain unterstützten Basisdateien sind .BRAIN. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PersonalBrain zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PersonalBrain verwendet werden.
Mit PersonalBrain können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PersonalBrain öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PersonalBrain unterstützten Dateiformat zu speichern.