Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Perl Builder unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Perl Builder unterstützten Basisdateien sind .PL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Perl Builder zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Perl Builder verwendet werden.
Mit Perl Builder können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Perl Builder öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Perl Builder unterstützten Dateiformat zu speichern.