Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Payroll Mate unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Payroll Mate unterstützten Basisdateien sind .ACH. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Payroll Mate zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Payroll Mate verwendet werden.
Mit Payroll Mate können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Payroll Mate öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Payroll Mate unterstützten Dateiformat zu speichern.