Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Panda Antivirus Pro unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Panda Antivirus Pro unterstützten Basisdateien sind .PAV. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Panda Antivirus Pro zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Panda Antivirus Pro verwendet werden.
Mit Panda Antivirus Pro können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Panda Antivirus Pro öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Panda Antivirus Pro unterstützten Dateiformat zu speichern.