Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PaintTool SAI unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von PaintTool SAI unterstützten Basisdateien sind .SAI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PaintTool SAI zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PaintTool SAI verwendet werden.
Mit PaintTool SAI können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PaintTool SAI öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PaintTool SAI unterstützten Dateiformat zu speichern.