Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. PAF unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von PAF unterstützten Basisdateien sind .PAF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in PAF zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von PAF verwendet werden.
Mit PAF können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über PAF öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von PAF unterstützten Dateiformat zu speichern.