Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. OnyxGRASS unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von OnyxGRASS unterstützten Basisdateien sind .ONX. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in OnyxGRASS zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von OnyxGRASS verwendet werden.
Mit OnyxGRASS können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über OnyxGRASS öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von OnyxGRASS unterstützten Dateiformat zu speichern.