Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. OM2 OMALI Professional unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von OM2 OMALI Professional unterstützten Basisdateien sind .NE3. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in OM2 OMALI Professional zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von OM2 OMALI Professional verwendet werden.
Mit OM2 OMALI Professional können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über OM2 OMALI Professional öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von OM2 OMALI Professional unterstützten Dateiformat zu speichern.