Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Obyx unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Obyx unterstützten Basisdateien sind .OBYX. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Obyx zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Obyx verwendet werden.
Mit Obyx können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Obyx öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Obyx unterstützten Dateiformat zu speichern.