Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Nmap unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Nmap unterstützten Basisdateien sind .NSE. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Nmap zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Nmap verwendet werden.
Mit Nmap können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Nmap öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Nmap unterstützten Dateiformat zu speichern.