Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. NetBeans unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von NetBeans unterstützten Basisdateien sind .GROOVY. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in NetBeans zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von NetBeans verwendet werden.
Mit NetBeans können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über NetBeans öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von NetBeans unterstützten Dateiformat zu speichern.