Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Nero BackItUp unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von Nero BackItUp unterstützten Basisdateien sind .NCO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Nero BackItUp zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Nero BackItUp verwendet werden.
Mit Nero BackItUp können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Nero BackItUp öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Nero BackItUp unterstützten Dateiformat zu speichern.