Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Navidoc unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Navidoc unterstützten Basisdateien sind .NVD. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Navidoc zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Navidoc verwendet werden.
Mit Navidoc können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Navidoc öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Navidoc unterstützten Dateiformat zu speichern.