Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. NaviComputer unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von NaviComputer unterstützten Basisdateien sind .NMAP. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in NaviComputer zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von NaviComputer verwendet werden.
Mit NaviComputer können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über NaviComputer öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von NaviComputer unterstützten Dateiformat zu speichern.