Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Navicat Premium unterstützt mindestens 33 verschiedene Dateiendungen. Die von Navicat Premium unterstützten Basisdateien sind .SQL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Navicat Premium zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Navicat Premium verwendet werden.
Mit Navicat Premium können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Navicat Premium öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Navicat Premium unterstützten Dateiformat zu speichern.