Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Navicat for SQlite unterstützt mindestens 10 verschiedene Dateiendungen. Die von Navicat for SQlite unterstützten Basisdateien sind .SQLITE. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Navicat for SQlite zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Navicat for SQlite verwendet werden.
Mit Navicat for SQlite können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Navicat for SQlite öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Navicat for SQlite unterstützten Dateiformat zu speichern.