Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. My Notes Keeper unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von My Notes Keeper unterstützten Basisdateien sind .MNK. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in My Notes Keeper zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von My Notes Keeper verwendet werden.
Mit My Notes Keeper können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über My Notes Keeper öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von My Notes Keeper unterstützten Dateiformat zu speichern.