Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MSHC Migration Utility unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von MSHC Migration Utility unterstützten Basisdateien sind .MSHC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MSHC Migration Utility zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MSHC Migration Utility verwendet werden.
Mit MSHC Migration Utility können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MSHC Migration Utility öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MSHC Migration Utility unterstützten Dateiformat zu speichern.