Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MPO Explorer unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von MPO Explorer unterstützten Basisdateien sind .MPO. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MPO Explorer zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MPO Explorer verwendet werden.
Mit MPO Explorer können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MPO Explorer öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MPO Explorer unterstützten Dateiformat zu speichern.