Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MPEG Streamclip unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von MPEG Streamclip unterstützten Basisdateien sind .REC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MPEG Streamclip zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MPEG Streamclip verwendet werden.
Mit MPEG Streamclip können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MPEG Streamclip öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MPEG Streamclip unterstützten Dateiformat zu speichern.