Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Motion JPEG Player unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Motion JPEG Player unterstützten Basisdateien sind .MJPG. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Motion JPEG Player zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Motion JPEG Player verwendet werden.
Mit Motion JPEG Player können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Motion JPEG Player öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Motion JPEG Player unterstützten Dateiformat zu speichern.