Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MODPlug Player unterstützt mindestens 6 verschiedene Dateiendungen. Die von MODPlug Player unterstützten Basisdateien sind .MOD. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MODPlug Player zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MODPlug Player verwendet werden.
Mit MODPlug Player können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MODPlug Player öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MODPlug Player unterstützten Dateiformat zu speichern.