Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Mobipocket eBook Creator unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Mobipocket eBook Creator unterstützten Basisdateien sind .OPF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Mobipocket eBook Creator zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Mobipocket eBook Creator verwendet werden.
Mit Mobipocket eBook Creator können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Mobipocket eBook Creator öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Mobipocket eBook Creator unterstützten Dateiformat zu speichern.