Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MKDS Course Modifier unterstützt mindestens 5 verschiedene Dateiendungen. Die von MKDS Course Modifier unterstützten Basisdateien sind .BTI. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MKDS Course Modifier zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MKDS Course Modifier verwendet werden.
Mit MKDS Course Modifier können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MKDS Course Modifier öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MKDS Course Modifier unterstützten Dateiformat zu speichern.