Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Minimal Board Editor unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Minimal Board Editor unterstützten Basisdateien sind .MB3. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Minimal Board Editor zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Minimal Board Editor verwendet werden.
Mit Minimal Board Editor können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Minimal Board Editor öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Minimal Board Editor unterstützten Dateiformat zu speichern.