Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Microsoft Certificate Manager unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von Microsoft Certificate Manager unterstützten Basisdateien sind .P7C. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Microsoft Certificate Manager zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Microsoft Certificate Manager verwendet werden.
Mit Microsoft Certificate Manager können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Microsoft Certificate Manager öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Microsoft Certificate Manager unterstützten Dateiformat zu speichern.