Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Microsoft Application Virtualization Sequencer unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Microsoft Application Virtualization Sequencer unterstützten Basisdateien sind .SPRJ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Microsoft Application Virtualization Sequencer zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Microsoft Application Virtualization Sequencer verwendet werden.
Mit Microsoft Application Virtualization Sequencer können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Microsoft Application Virtualization Sequencer öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Microsoft Application Virtualization Sequencer unterstützten Dateiformat zu speichern.