Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. mgflib2 unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von mgflib2 unterstützten Basisdateien sind .MGF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in mgflib2 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von mgflib2 verwendet werden.
Mit mgflib2 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über mgflib2 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von mgflib2 unterstützten Dateiformat zu speichern.