Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. messiahStudio unterstützt mindestens 4 verschiedene Dateiendungen. Die von messiahStudio unterstützten Basisdateien sind .3DS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in messiahStudio zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von messiahStudio verwendet werden.
Mit messiahStudio können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über messiahStudio öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von messiahStudio unterstützten Dateiformat zu speichern.