Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Merak Peep unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Merak Peep unterstützten Basisdateien sind .PEX. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Merak Peep zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Merak Peep verwendet werden.
Mit Merak Peep können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Merak Peep öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Merak Peep unterstützten Dateiformat zu speichern.