Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MediaTracker unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von MediaTracker unterstützten Basisdateien sind .MTC. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MediaTracker zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MediaTracker verwendet werden.
Mit MediaTracker können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MediaTracker öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MediaTracker unterstützten Dateiformat zu speichern.