Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Medbasin unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Medbasin unterstützten Basisdateien sind .KDT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Medbasin zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Medbasin verwendet werden.
Mit Medbasin können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Medbasin öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Medbasin unterstützten Dateiformat zu speichern.