Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MapGuide Enterprise unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von MapGuide Enterprise unterstützten Basisdateien sind .MWF. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MapGuide Enterprise zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MapGuide Enterprise verwendet werden.
Mit MapGuide Enterprise können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MapGuide Enterprise öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MapGuide Enterprise unterstützten Dateiformat zu speichern.