Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MagicPlot unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von MagicPlot unterstützten Basisdateien sind .MPPZ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MagicPlot zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MagicPlot verwendet werden.
Mit MagicPlot können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MagicPlot öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MagicPlot unterstützten Dateiformat zu speichern.