Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. MacDjView unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von MacDjView unterstützten Basisdateien sind .DJVU. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in MacDjView zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von MacDjView verwendet werden.
Mit MacDjView können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über MacDjView öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von MacDjView unterstützten Dateiformat zu speichern.