Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Macapaka unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Macapaka unterstützten Basisdateien sind .FPK. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Macapaka zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Macapaka verwendet werden.
Mit Macapaka können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Macapaka öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Macapaka unterstützten Dateiformat zu speichern.