Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. m4 unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von m4 unterstützten Basisdateien sind .M4. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in m4 zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von m4 verwendet werden.
Mit m4 können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über m4 öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von m4 unterstützten Dateiformat zu speichern.