Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Logos Bible Sofware unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von Logos Bible Sofware unterstützten Basisdateien sind .LBXLLS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Logos Bible Sofware zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Logos Bible Sofware verwendet werden.
Mit Logos Bible Sofware können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Logos Bible Sofware öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Logos Bible Sofware unterstützten Dateiformat zu speichern.