Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. LabWindows unterstützt mindestens 3 verschiedene Dateiendungen. Die von LabWindows unterstützten Basisdateien sind .UIR. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in LabWindows zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von LabWindows verwendet werden.
Mit LabWindows können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über LabWindows öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von LabWindows unterstützten Dateiformat zu speichern.