Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. JUDE/Professional unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von JUDE/Professional unterstützten Basisdateien sind .JUDE. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in JUDE/Professional zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von JUDE/Professional verwendet werden.
Mit JUDE/Professional können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über JUDE/Professional öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von JUDE/Professional unterstützten Dateiformat zu speichern.