Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Jigsaw Puzzle unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Jigsaw Puzzle unterstützten Basisdateien sind .JIGZ. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Jigsaw Puzzle zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Jigsaw Puzzle verwendet werden.
Mit Jigsaw Puzzle können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Jigsaw Puzzle öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Jigsaw Puzzle unterstützten Dateiformat zu speichern.