Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Jewel Quest unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von Jewel Quest unterstützten Basisdateien sind .CFGE. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Jewel Quest zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Jewel Quest verwendet werden.
Mit Jewel Quest können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Jewel Quest öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Jewel Quest unterstützten Dateiformat zu speichern.