Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. jetAudio unterstützt mindestens 18 verschiedene Dateiendungen. Die von jetAudio unterstützten Basisdateien sind .MP3. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in jetAudio zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von jetAudio verwendet werden.
Mit jetAudio können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über jetAudio öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von jetAudio unterstützten Dateiformat zu speichern.