Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. jEdit unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von jEdit unterstützten Basisdateien sind .M. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in jEdit zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von jEdit verwendet werden.
Mit jEdit können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über jEdit öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von jEdit unterstützten Dateiformat zu speichern.