Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. IRAF unterstützt mindestens 2 verschiedene Dateiendungen. Die von IRAF unterstützten Basisdateien sind .IRAFHOSTS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in IRAF zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von IRAF verwendet werden.
Mit IRAF können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über IRAF öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von IRAF unterstützten Dateiformat zu speichern.