Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Intuition unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Intuition unterstützten Basisdateien sind .MTML. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Intuition zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Intuition verwendet werden.
Mit Intuition können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Intuition öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Intuition unterstützten Dateiformat zu speichern.