Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. Infected Windows systems unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von Infected Windows systems unterstützten Basisdateien sind .QIT. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in Infected Windows systems zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von Infected Windows systems verwendet werden.
Mit Infected Windows systems können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über Infected Windows systems öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von Infected Windows systems unterstützten Dateiformat zu speichern.