Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. ICUpilot unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von ICUpilot unterstützten Basisdateien sind .PIL. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in ICUpilot zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von ICUpilot verwendet werden.
Mit ICUpilot können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über ICUpilot öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von ICUpilot unterstützten Dateiformat zu speichern.