Standardmäßig unterstützt jede Software mehrere Dateiendungen. HyperSnap unterstützt mindestens 1 verschiedene Dateiendungen. Die von HyperSnap unterstützten Basisdateien sind .DHS. Es werden jedoch nicht immer alle in der Liste aufgeführten Dateiendungen verwendet, um die Auswirkungen der Arbeit in HyperSnap zu speichern. Sehr oft werden Dateien mit solchen Dateiendungen als Quelldatendateien verwendet, die von HyperSnap verwendet werden.
Mit HyperSnap können Dateiformate zwischen den unten aufgeführten Dateiendungen konvertiert werden. Sie können eine Datei mit einer der folgenden Dateiendungen über HyperSnap öffnen und versuchen, sie in einem anderen, ebenfalls von HyperSnap unterstützten Dateiformat zu speichern.